De to flyene ble ledsaget av tre svenske Jas-kampfly og bakgrunnen var en øvelse på å minelegge farvannet øst for Öland, opplyser den svenske forsvarsledelsen.
Hensikten med slik minelegging er å forsinke en eventuell angriper til Sverige kan få hjelp utenfra, ifølge Försvarsmakten.
– I lys av vår søknad om medlemskap i Nato, blir akkurat dette ekstra viktig, sier forsvarsledelsens talsmann Erik Karlsson.
Hvorfor de to store B-52-flyene måtte fly rett over sentrum av den svenske hovedstaden og Kungliga slottet, er ikke kjent.